1991년 신촌성결교회 담임목사로 부임하여 20년 넘게 섬기고 있다. 그동안 신촌성결교회는 영성과 지성이 조화를 이루는 건강한 교회로 발전해왔다. 젊은이들이 많은 신촌 지역에 위치한 특성을 살 려 20~40대가 70%에 달하는. 젊고 건강한 교회로 성장하여 교계에서도 많은 주목을 받고 있다. 이정익 목사는 화려하고 요란한 행사를 자제하고 예배에 충실한 목회에 중심을 두고 있다. 목소리를 높이거나 큰 제스처를 쓰지 않으면서도 모두가 이해하기 쉽고 편안하게. 깊이 있고 힘 있게 말씀을 전하는 목회자로 평가받고 있다. 이 밖에도 월드비전 이사. 대한성서공회 이사. 서울신학대학교 이사장. CBS기독교방송 이사장 등 다양한 활동을 통해 인화. 섬김. 나눔의 목회 철학을 실천하고 있다.