개혁주의학술원은 한국 교회와 대학, 그리고 사회를 위한 역사적 개혁주의 신학과 신앙의 새로운 부흥을 목적으로 설립되었다. 학술원은 칼빈을 위시한 개혁자들에 대한 보다 심층적인 연구를 수행하기 위해 다시 원전으로 돌아가는 연구운동을 전개하여 개혁주의 신학의 본래적 정체성과 생명력을 회복시키고 한국 개혁신학의 창의적 연구와 시니학적 자립을 위한 길을 열어가도 록 노력할 것이다. 학술원은 정기적 국제 또는 국내 학술 세미나를 통하여 개혁 신학과 신앙에 대한 깊이 있는 학술적 연구와 교육을 수행해 갈 것이다. 그리고 대학의 개혁주의 교육이념 구현을 위한 기독교적 학문연구와 교육교재 및 연수 프로그램을 개발하고 지원할 것이다. 또한 개혁주의 신앙의 확산을 위한 "개혁신앙 아카데미"와 건강한 개혁교회 건설을 위한 "갱신과 부흥 포럼"을 운영하 여 교회와 사회를 섬기도록 노력할 것이다. 학술원은 최상의 개혁신학 연구기반을 형성하기 위해 개혁주의 및 칼빈과 관련된 모든 연구도서와 연구논문을 총괄 수집하여 폭넓은 연구를 지원할 수 있는 세계적인 <개혁주의 전문도서관>을 만들어 갈 것이다. 그리고 개혁주의관련 연구소 및 연구인 력의 네트워크를 형성하고 홈페이지 운영을 통하여 연구 정보와 자료를 효율적으로 제공하여 교회와 학자들간의 연구 및 신앙 의 교류를 확대해 가려고 한다. 학술원은 역사적 개혁주의 신학과 신앙의 회복이야말로 오늘 교회와 대학 그리고 사회의 어두운 현실을 타개하고 밝은 미래를 약속할 수 있는 가장 바른 길이라고 믿는다.