배요한 목사는 연세대학교 신과대학과 장로회 신학대학(M.Div)을 졸업하였다. 이어 장신대 석사(Th.M 구약) 과정을 졸업했으며, 예수전도단 CDTS(캐나다밴쿠버) 과정을 수료하였다. 현재 장신대 구약학 박사 과정(Th.D)중에 있다.